张淑芹（复旦大学数学科学学院）

时间：9月23日 14: 30-16：00

腾讯会议：会议号：207748406，会议密码：300999

题目：单细胞空间转录组的细胞类型注释方法

摘要：近年来，单细胞空间转录组技术的快速发展使我们能够在保留细胞空间位置信息的同时，全面解析其基因转录表达水平。细胞类型注释作为单细胞空间转录组数据分析的关键环节，对揭示细胞类型的空间分布规律、阐明细胞与其微环境之间的复杂相互作用具有重要意义。本报告将介绍我们最近提出的基于参考数据集的细胞类型标注方法及参考数据集的选取方法，并通过多组实验验证所提出方法的有效性与稳健性。

介绍：张淑芹，复旦大学数学科学学院教授，博士生导师。主要研究数据驱动的数学、统计模型及算法，尤其是生物医学数据中的相关问题，包括单细胞数据和空间转录组数据分析方法、多种生物医学数据的整合等。目前主持国家自然科学基金、上海市科委“科技创新行动计划”等项目, 参与国家重点研发等项目，相关工作发表于交叉学科、数据科学、应用数学等领域的重要期刊。